高新技術企業(yè)認定審計肯定是在高新技術企業(yè)的基礎上才能去操作的，所以，想要申報高新技術企業(yè)認定審計，首先需要認定企業(yè)為高新技術企業(yè)。一定要先認定為高新技術企業(yè)，才能申報高新技術企業(yè)認定審計。

申報明細表與年度財務報表相關聯(lián)，是指企業(yè)近三個會計年度研究開發(fā)費用結構明細表和近一年高新技術產(chǎn)品(服務)收入明細表的相關數(shù)據(jù)包含在已審計的年度財務報表中，兩者適用的會計準則或會計制度是一致的，在相關會計政策、會計估計方面不存在差異。

不論企業(yè)以前年度財務報表是否委托注冊會計師進行審計，還是專項審計與年度財務報表審計是否為同一家會計師事務所承接，專項審計都可以按照《專項審計指引》獨立實施審計程序。如果結合以前年度財務報表審計，確定的重要性水平應當?shù)陀谙鄳攧請蟊韺徲嫷闹匾运?，確定審計范圍時應當考慮擬利用以前年度財務報表審計工作中獲取的審計證據(jù)的程度。需要注意的是，應當結合具體環(huán)境考慮重要性的性質和數(shù)量兩方面的因素。

無論是研究開發(fā)費用，還是高新技術產(chǎn)品(服務)，在專項審計中都涉及高新技術的識別。注冊會計師不是高新技術領域的專家，《專項審計指引》為此做了如下規(guī)定：

(1)恰當界定研究開發(fā)項目、高新技術產(chǎn)品(服務)的具體范圍是申報企業(yè)的責任。

(2)申報企業(yè)技術負責人與企業(yè)法定代表人、財務負責人共同簽署《管理當局聲明書》。

但《專項審計指引》也規(guī)定，制定總體審計策略時，應當清楚地說明向具體審計領域調配的資源，包括就復雜的研究開發(fā)項目技術問題利用專家的工作。